Borgen uppfördes under 1400-talets senare hälft. Borgen, som har en stor del av de ursprungliga murarna bevarade, består egentligen av två stenhus som fogades samman omkring år 1500. Bollerups borg övergick först år 1750 från dansk till svensk ägo och tillhör idag Bollerups lantbruksinstitut, ett stort landbruk med omfattande djurhållning. Intill borgen ligger den rundtornsförsedda Bollerups kyrka.